Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms