Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSX2P58304 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX2P58304 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX2P58304 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSX2P58304 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSX2P58304 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms