Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CABP4P57796 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CABP4P57796 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms