Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP107P57740 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP107P57740 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1975.8 ms