Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRP55822 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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