Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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