Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT6CP48668 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms