Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RANGAP1P46060 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms