Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR4A2P43354 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms