Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms