Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms