Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGDSP41222 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms