Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDNFP39905 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDNFP39905 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms