Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL9P32969 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms