Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H1P32780 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms