Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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CASQ1P31415 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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CASQ1P31415 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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CASQ1P31415 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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CASQ1P31415 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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