Protein–RNA interactions for Protein: P30039

PBLD, Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBLDP30039 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBLDP30039 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBLDP30039 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBLDP30039 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PBLDP30039 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBLDP30039 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBLDP30039 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBLDP30039 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PBLDP30039 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms