Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRMP28827 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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