Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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HOXD10P28358 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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HOXD10P28358 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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HOXD10P28358 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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HOXD10P28358 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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HOXD10P28358 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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HOXD10P28358 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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