Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PEX2P28328 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms