Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms