Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PLNP26678 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms