Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms