Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms