Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFTRP13569 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFTRP13569 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFTRP13569 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFTRP13569 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFTRP13569 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFTRP13569 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFTRP13569 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFTRP13569 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFTRP13569 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms