Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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