Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC159P0C7I6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms