Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLK3P07288 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLK3P07288 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLK3P07288 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms