Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAVP06756 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms