Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERPIND1P05546 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPIND1P05546 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms