Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms