Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POP4O95707 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POP4O95707 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POP4O95707 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms