Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNOT4O95628 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNOT4O95628 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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