Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSVO60911 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSVO60911 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSVO60911 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms