Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms