Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PDE6DO43924 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6DO43924 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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