Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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