Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNPHO15079 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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