Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CEP290O15078 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP290O15078 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP290O15078 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP290O15078 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP290O15078 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CEP290O15078 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP290O15078 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP290O15078 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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