Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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