Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms