Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF879B4DU55 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms