Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms