Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ08

MBD3L5, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L5A6NJ08 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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MBD3L5A6NJ08 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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MBD3L5A6NJ08 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MBD3L5A6NJ08 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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