Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00312Q9Y6C7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms