Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSAG2Q9Y5P2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSAG2Q9Y5P2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms