Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms