Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms