Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF13BQ9Y275 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms