Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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